Сайт создан на платформе Nethouse. Хотите такой же?
Владельцу сайта

Открыт новый тип белковой структуры - метиониновая спираль


Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

http://www.myshared.ru/slide/643151/

Цитата: 15  МЕТИОНИН - незаменимая АМК. Необходима для синтеза белков, участвует в реакциях дезаминирования, является источником серы для синтеза цистеина. Метионил-тРНК участвует в инициации трансляции. Метильная группа метионина - мобильный одноуглеродный фрагмент, используемый для синтеза ряда соединений в реакциях переноса этой группы на соответствующий акцептор (реакция транс- метилирования) Метильная группа в молекуле метионина прочно связана с атомом S, поэтому непосредственным донором этого одноуглеродного фрагмента служит активная форма метионина - S-аденозилметионин (SAM) 
16  S-аденозилметионин (SAM) - сульфониевая форма метионина, образующаяся при его присоединении к молекуле аденозина (продукта гидролиза АТФ) Реакция активации метионина Присутствует во всех типах клеток Структура (S + -CH 3 ) в SAM - нестабильная группировка, определяющая высокую активность метильной группы (отсюда термин «активный метионин»). Это уникальная реакция, единственная, в результате которой освобождаются все три фосфатных остатка АТФ. Отщепление метильной группы от SAM и перенос ее на соединение -акцептор катализируют метилтрансферазы в реакциях транс- метилирования. SAM в ходе реакции превращается в S-аденозилгомоцистеин (SAГ). 
Конец цитаты.

Кушелев: Понятно. Связь Met-Cys косвенно подтверждается, т.к. Cys образуется из Met, а значит, что в мышином лизоциме тоже возможно превращение Met в Cys в процессе дозревания белка.

https://img-fotki.yandex.ru/get/196070/158289418.3c3/0_17074a_a85f2577_XL.gif



Открыт новый тип белковой структуры!

http://nanoworld.org.ru/post/82432/#p82432

>NM_207361.5 Homo sapiens FRAS1 related extracellular matrix protein 2 (FREM2), mRNA

Вторичная структура (Пикотех-2017) весит около 6 мегабайт в стандарте PNG: https://cloud.mail.ru/public/KKjH/goMgmMGAn

На яндекс-фотки не грузится. Но самый интересный фрагмент удалось вырезать в программе Paint:

https://img-fotki.yandex.ru/get/198361/158289418.3c3/0_170b41_4189c7d2_orig.png

Сиреневым цветом отмечен виток необычной метиониновой спирали. В отличие от альфа-спирали у неё более длинный шаг. Метиониновая спираль отличается от обычной альфа-спирали примерно как резьба с более крупным шагом от резьбы с менее крупным шагом:

https://img-fotki.yandex.ru/get/51827/158289418.3c3/0_170b47_51f461c_XL.jpg

Шаг метиониновой спирали примерно на 25% крупнее шага обычной альфа-спирали. При этом на один виток приходится тоже 3.6...3.7 аминокислотных остатка Met.

 

https://img-fotki.yandex.ru/get/196020/158289418.3c3/0_170b49_279861eb_orig.png


Ещё один интересный участок этого белка 3916...4164. Он содержит все типы композиционных кодов: 1,2,3,4, но ... не содержит ни одного витка спирали! Интересно оценить вероятность случайной комбинации композиционных кодов такого типа. Напомню, что спираль возникает при трёхкратном (или более) повторении кодов 1, 4 или их комбинации. При этом третий код должен быть "4", либо спиральных кодов (1,4), идущих подряд, должно быть больше 3.

 

 

https://img-fotki.yandex.ru/get/196020/158289418.3c3/0_170b4a_2d1597d3_orig.png


Белковая молекула кончается витком полилизиновой пи-спирали, похожей на винт Архимеда.

 

 

 

Подробнее 

 Обсуждение